微孔濾膜的主要功能是從氣相或者液相中截留微粒，細菌及其他雜質，以達到分離，凈化，提純的目的。因此選擇濾膜要考慮以下幾個因素：
1.濾膜的材質（化學兼容性）：選擇濾膜時，首先要考慮化學相容性。濾器是否耐酸、堿、有機溶劑等。具體參見濾膜化學相容性表。
2.濾膜的孔徑：根據需要過濾的分子或顆粒的大小來確定正確范圍的濾膜孔徑。
3.樣品的特性：
1）親水性樣品：選用親水膜片。對水有親和力，適合過濾水為基質的溶液。可用的濾膜有：混合纖維素膜，聚醚砜（PEsM）,NylonM等。
2）強腐蝕性有機溶劑：一般采用疏水性膜。如PTFEM，聚丙烯（PPM）等材質的濾膜
3）蛋白溶液：選擇低蛋白吸附的濾膜，如PVDF濾膜。
4）離子色譜：通常認為PEs濾膜比較適合低無機離子的溶液的過濾。
4、kenker membranes快速選擇表（Since different elements in terms of impact, the data for reference only）